سفر به اعماق تاریکی

داستان فیلم در مورد فرمانده جوانی به نام "کرک" است که در ماموریت خود با سفینه اینترپرایز که در یک ماموریت فضایی بوده درست عمل نکرده است و به ستاد فرماندهی احضار می‌شود. در حین جلسه بررسی پرونده او ،ناگهان شخصی به نام "شان" به مقر فرماندهی حمله می کند. کرک با گروهی به تعقیب شان رفته و او را دستگیر می کند. شان پس از بازداشت خود می گوید: اگر او را بکشند .....